核爆默示錄全集動畫以2036年日本東京因核電廠發生爆炸為背景,講述的是全市受到嚴重的核輻射汙染而遭到封鎖,於此同時只有三名經過基因改造的女高中生成立了一支代號為「柯佩莉昂娃娃」的救援隊伍,他們的體內天生具有輻射抗體,僅僅三人,她們以自己的眼睛去搜尋著生還者。 這座曾座曾經是繁榮首都的城市如今變成了死城,在救援過程中她們面臨著危險的斷垣殘壁以及恐怖的變種生物,她們究竟如何突出重圍呢。